โรงเรียนบ้านปากทางท่าลี่เดิมชื่อว่า โรงเรียนประชาบาล 3 (ปากทางท่าลี่) เป็นโรงเรียนหลังที่สาม ของตำบลบ้านหลวง ผู้ริเริ่มก่อตั้ง'โรงเรียนคนแรก คือ นายทุนละ และนางศรีวรรณ วงคํไควรรณ เมื่อ พ.ศ. 2474 โดยได้สร้างอาคารชั่วคราวขึ้น 1 หลัง สิ้นงบประมาณ 30 บาท และได้จ้าง นายกิมเสียว ลี้พาณิชย์ มาเป็นครูสอนคนแรกโดยมีนักเรียนประมาณ 40คน
พ.ศ. 2475 อำเภอจอมทอง ได้อนุมัติเงิน จำนวน 600 บาท เพื่อสร้างอาคารหลังใหม่อยู่ติดลับ ถนนสายเชียงใหม่ - ฮอด
ต่อมา พ.ศ.2479 อาคารหลังนี้ได้ทรุดโทรม นายเจริญ สุวรรณประเทศ ตำแหน่ง ครูใหญ่ ลับนาย สมาน เยสุวรรณ ศึกษาธิการอำเภอจอมทอง และนายตั๋น มโนราห์ ผู้ใหญ่บ้าน ได้ย้ายโรงเรียนไปตั้งใหม่ บริเวณวัดมงคลวารี ต่อมาได้เปลี่ยนชื่อเป็น “โรงเรียนบ้านปากทางท่าลี่” ตามคำสั่งของ กระทรวงศึกษาธิการ เมื่อ พ.ศ. 2487
พ.ศ. 2498 นายสะอาด เหมือนสุทธิวงศ์ ได้ย้ายมาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ และได้ร่วมมือลับนาย สมาน เยสุวรรณ ของบประมาณปรับปรุงโรงเรียน จำนวน 1,500 บาท โดยใช้โครงสร้างอาคารเป็นไม้เนื้อ แข็ง
พ.ศ. 2504 ได้รับงบประมาณซ่อมแซมเป็นเงิน 5,000 บาท โดยมี นายชัช สร้อยจาตุรงค์ เป็น ศึกษาธิการอำเภอจอมทอง นายสะอาด เหมือนสุทธิวงศ์ครูใหญ่ และนายสม ใจมะโน ผู้ใหญ่บ้านได้ขยาย บ้องเรียนอีก 2 บ้อง มุขกลางอีก 1 ห้อง หลังคามุงกระเนื้องพื้นเมือง ฝาไม้เนื้ออ่อน ประดูและหน้าต่างไม้ลัก ได้รับความร่วมมือจาก นายภูมิ วิเศษคิริ หัวหน้าตอนสองแคว และได้ทำบุญฉลอง เมื่อวันที่ 2 กันยายน 2504
พ.ศ. 2512 ได้รับเงินซ่อมแซมอีกจำนวน 1 7,000 บาท โดยนายสุพจน์ ชวลิตพงษ์ ศึกษาธิการอำเภอ และนายสะอาด เหมือนสุทธิวงศ์เครูใหญ่ ได้ทำการซ่อมแซมโดยใช้โครงสร้างไม้เนื้อ แข็งพื้นคอนกรีต เมื่อ 16 สิงหาคม 2512
พ.ศ. 2524 นายสะอาด เหมือนสุทธิวงศ์ ครูใหญ่ ร่วมกับผู้ใหญ่บ้านและคณะกรรมการศึกษา โรงเรียน ได้ขอบริจาคที่ดินจาก คุณชำนิ วิศวะผลบุญ เนื้อที่ 2 ไร่ 40 ตารางวา
พ.ศ. 2525 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเอนกประสงค์ แบบ สปช.202 จำนวน 1 หลัง งบประมาณ 250,000 บาท
ปี พ.ศ. 2526 ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารเริยน ป.1 ก. ตึก อีก 2 ห้อง จำนวน 250,000 บาท และ ได้รับงบประมาณก่อสร้าง สนามบาสเกตบอล 1 สนาม จากงบพัฒนาจังหวัดตามข้อเสนอ ของ ส.ส.อำนวย ยศสุข จำนวน 25,000 บาท
พ.ศ. 2528 ได้รับบริจาคที่ดินจาก คุณชำนิ วิศวะผลบุญ เพิ่มอีก 8 ไร่ 1 งาน 56 ตารางวา คิด
เป็นเงิน 180,000 บาท เมื่อวันที่ 25 คุมภาพันธ์2528
พ.ศ. 2537 เปิดทำการสอน 3 ระดับ คือ ระดับก่อนประถมศึกษา ระดับประถมศึกษา ระดับ มัธยมศึกษาตอนด้น ตามโครงการขยายโอกาสทางการศึกษาพ.ศ. 2538 ได้รับงบประมาณสร้างสนาม บาสเกตบอล สปช. ขนาดกว้าง 18.10 เมตร ยาว 31.12 เมตร งบประมาณ 128,000 บาท
พ.ศ. 2539 ได้รับงบประมาณสร้างอาคาร แบบ สปช. 105/29 จำนวน 1 หลัง 4 ห้องเริยน งบประมาณ 1,466,328 บาท
พ.ศ. 2550 ได้โรงเริยนเปิดทำการสอน ตั้งแต่ระดับชั้นอนุบาล 1 ถึงระดับมัธยมศึกษาปีที่ 3 มี นักเริยนจำนวน231คน เป็นชาย 131คน หญิง 100คนมีข้าราชการครูทั้งหมด 17 คน ไปช่วยราชการ 1 คน มีนายเกียรติศักดิ๙ อดทน เป็นผู้อำนวยการโรงเริยน
พ.ศ. 2553 ได้รับงบประมาณสร้างอาคารแบบ สปช. 105/29 จำนวน 1 หลัง 4 ห้องเริยน งบประมาณ 2,536,200 บาท
พ.ศ. 2555 นายจำเนียร ไตรมาตร ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเริยน และใน ปี พ.ศ. 2556 ได้ปรับปรุงและซ่อมแซมรั้วโรงเริยน ใช้งบประมาณจำนวน 230,000 บาท ปรับปรุงและ ซ่อมแซมเสาธง งบประมาณ จำนวน 40,000 บาท ก่อสร้างโรงรถครุ ใช้งบประมาณ จำนวน 45,000 บาท และปรับปรุงถนนทางเข้าโรงเริยนและหน้าอาคารเริยน ใช้งบประมาณ จำนวน 100,000 บาท
พ.ศ. 2559 ได้รับงบประมาณสร้างลานกีฬาเอนกประสงค์ และปรับปรุงอาคารห้องสมุด โดยได้รับงบประมาณสนับสนุนจากสำนักงานเขตพื้นที่ฯและเงินจากศิษย์เก่า
พ.ศ. 2561 นายกำพล คำแปง ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเริยนบ้านปากทางท่าลี่